导语
肿瘤突变负荷(Tumor mutational burden,TMB)是公认的免疫治疗反应预测生物标志物。威尼斯9499登录入口自主研发的非小细胞肺癌组织TMB检测试剂盒(可逆末端终止测序法)(国械注准:20233401452)于2023年10月12日获NMPA批准上市(以下简称“世和一号®试剂盒”),成为国内肿瘤基因检测行业的首个且唯一一个NGS大Panel体外诊断产品。世和一号®试剂盒的问世,开启了国内TMB检测的合规之路。
近日,美国分子病理学协会(AMP)召集美国临床肿瘤学会(ASCO)、美国病理学家协会(CAP)和癌症免疫治疗学会(SITC)组成了一个多学科TMB工作小组,基于文献综述、调查数据和专家共识等现有证据发布了TMB联合共识建议,对TMB计算、报告和解释的标准化提出见解[1]。威尼斯9499登录入口两项TMB合作临床研究被共识引用。
TMB联合共识建议
基于文献综述、调查数据和专家共识,联合共识给出了13条针对TMB检测的专家建议,这些建议涵盖了TMB的技术验证、报告要求和文献发表,重点关注TMB分析的技术细节。
建议1:实验室应验证和报告在TMB检测中使用的富集方法
建议2:实验室应验证和报告用于TMB计算的基因组区域(即外显子、内含子和基因间隔区)的大小和描述
建议3:实验室应通过正交试验验证TMB检测结果,并应记录正交比较试验所使用的TMB计算方法
TMB检测方法缺乏统一性,富集方法(WES还是Panel)和覆盖区域都会影响TMB的计算。另外,仅使用外部参考品来判断TMB检测的分析性能并不全面和准确。工作小组建议对所有TMB检测进行正交验证研究(如WES),以衡量其性能。
世和一号®试剂盒可检测人类基因组上与肿瘤发生发展及治疗预后等高度相关的425个基因。在临床前研发阶段,世和一号®试剂盒完成了包括生产工艺/反应体系、分析性能、最低检测限、阳性判断值、稳定性以及与WES一致性验证等多方面超万例检测研究,经反复验证顺利通过了中国食品药品检定研究院(中检院)的全套TMB国家参考品及肿瘤相关基因突变国家参考品注册检验。
建议4:实验室应提供验证样本,以反映TMB检测在标本类型和代表性肿瘤类型方面的预期用途
建议5:实验室可以使用参考品作为TMB检测验证的补充,但不能替代临床样本
根据实践调查结果,缺乏具有明确TMB的样本用于检测开发和验证是TMB检测实施的主要障碍。威尼斯9499登录入口是中检院TMB检测国家参考品协作单位之一,积极参与了中检院TMB检测标准品/参考品的标定工作。
临床验证方面,世和一号®试剂盒在多家中心点完成了包括TMB一致性、TMB相关性、特定基因检测准确性和多种突变类型检测准确性等多层面超千例临床病例验证。
建议6:实验室可以使用计算机验证研究来补充但不能取代TMB检测的湿实验验证
建议7:实验室应在TMB检测验证期间指定TMB检测使用的测序模式(肿瘤体系-胚系配对或仅肿瘤体系);如果进行仅肿瘤体系测序,用于去除常见群体变异的过滤算法设置也应记录在案
建议8:实验室应在验证过程中建立用于TMB计算的生物信息学流程的性能参数
世和一号®试剂盒拥有完整的生物信息学分析流程,各项性能参数经过严格验证。该产品通过采用自主创新的单肿瘤样本检测技术,不依赖白细胞对照样本配对检测分析,做到以IVD试剂盒的可靠形式,更便利地开展院内检测。
建议9:实验室应报告临床TMB检测所用的检测名称、版本和测序平台
建议10:实验室应报告用于TMB计算的生物信息学流程软件组件的名称、版本、属性和/或设置
建议11:实验室应报告TMB计算中包含和排除的变异具体类型和/或类别
建议12:实验室应报告TMB检测所使用的测序模式(肿瘤体系-胚系配对或仅肿瘤体系);如果进行仅肿瘤体系测序,应提供用于去除常见群体变异的过滤算法设置,或应要求提供
目前,世和一号®试剂盒已服务全国100多家三甲及肿瘤专科医院,为肿瘤临床提供标准化检测服务和报告。威尼斯9499登录入口在包括实验室建设、检测流程标准化培训、全流程自动化工作站、生信与报告一体机、质控体系、性能验证、专业人员培训和长期技术支持等方面积累了多年经验。
建议13:描述用于临床应用的TMB检测出版物(包括临床验证描述)应包括有助于方法学评估的性能特征
威尼斯9499登录入口两项TMB合作临床研究被引入本次的共识推荐:与中山大学附属肿瘤医院张力教授团队合作的肺癌免疫治疗标志物研究[2],该研究基于中国肺癌人群大样本量免疫药物临床试验,证实了世和一号®大Panel检测TMB的准确性,以及TMB作为免疫治疗疗效预测标志物在中国肺癌人群中的普适性;与中山大学肿瘤防治中心黄欣教授、蓝春燕教授团队合作的宫颈癌免疫治疗标志物研究[3],该研究对CLAP试验中卡瑞利珠单抗联合阿帕替尼治疗组患者的靶向测序数据进行了二次分析,证实了TMB在免疫联合抗血管治疗中同样具有预测价值。
结语
本次AMP发布的联合共识总结了当前与TMB检测相关的知识和挑战,提供了在临床环境下进行TMB检测的专家建议,为更精准的肿瘤个性化治疗提供了强有力的指导。国内首个且唯一一个NGS大Panel体外诊断产品世和一号®试剂盒的获批,加快了国内肿瘤NGS行业整体合规化的进程,也为后续其他NGS大Panel产品的获批提供了新的参考思路。
参考文献
[1] Furtado, et al. The Journal of Molecular Diagnostics. DOI: 10.1016/j.jmoldx. 2024.05.002, (2024)
[2] Wenfeng Fang, et al. Clinical Cancer Research. CCR-19-0585, DOI: 10.1158/ 1078-0432. (2019)
[3] Huang X, et al. Journal for ImmunoTherapy of Cancer. 2021;9(5):e002223. DOI: 10.1136/jitc-2020-002223. (2021)